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绩效审计与财务审计的关系
所谓绩效审计就是由审计机构或审计人员，依据有关法规和标准，对被审计单位管理和使用公共资源的经济性、效益性和效果性进行的检查和评价，提出建议，促进改善经营管理，提高效益的一种独立性的经济监督活动。但在实际探索中绩效审计在实施方式上至今未形成独立的审计形态，绩效审计主要是依附在财务审计、财政预算执行审计、项目资金审计等常规审计中进行，然而他们之间又存在着一些联系和不同。
1、绩效审计与财务审计的关系
从审计的目标上看，财务审计主要是为了查错防弊，注重财务收支及经济活动的真实性， 合法性;绩效审计则是为了评价投入资金的使用效益以及所取得的效果(经济性、效益性和效果性)。从审计方法上看，绩效审计和财务审计有许多通用的方法，但绩效审计更多是借鉴相关学科的分析方法(如财务分析，统计分析，财务管理等学科的知识)，更具有科学性和综合性。从目前我们审计的主要工作对象——行政事业单位看，绩效审计的开展应建立在被审计单位财务收支及其经济活动的真实性、合法性基础之上，如果被审计单位财务收支都存在问题，又有何效益可言。随着社会对公共财政意识的增强，对行政事业单位财务审计已不能只停留在真实性、合法性这一层面上，绩效审计应是财务审计发展到一定阶段后的必然结合。
2、绩效审计与经济责任审计的关系
经济责任审计关注领导干部履行经济责任的效益性和效果性，就是绩效审计理念的一个体现。
绩效审计和经济责任审计的区别：从审计的客体角度看，经济责任审计是针对一个组织的主要负责人所承担的任期经济责任目标的审查、鉴证与评价，审计的客体是“人”，而绩效审计针对的是“事”。从审计的内容来看经济责任审计体现的是合规性审计和绩效审计的结合，包括的内容有预决算，专项资金，固定资产保值增值、重大决策、工作目标、遵守财经法规和勤政廉政等，应该说经济责任审计涵盖的内容可以大于绩效审计的范围。
经济责任审计与绩效审计都含有评价、鉴证履行经济责任绩效的本质特征，从法规制度层面上看《党政主要领导干部和国有企业领导人员经济责任审计规定》，标志着经济责任审计已具有法律法规的强制力，绩效审计目前还在探索阶段，没有法律法规依据，所以，现阶段做好经济责任审计不失为探索绩效审计的较好途径。
3、绩效审计与专项审计的关系
专项审计主要围绕财政专项资金的使用情况、相关政策规定的执行情况以及项目完成效果来开展。国家有关项目支出预算管理办法中规定，项目支出预算管理应遵循“追踪问效”的原则，对项目完成结果进行绩效评价，所以专项审计在某种意义上就是专项资金的绩效审计。随着社会公共事业的发展，项目支出比例逐年增大，专项审计已成为审计工作的重要组成部分，从绩效审计角度看，专项资金的绩效审计也是我们实践绩效审计操作办法较好的突破口。